海珠区辖内共有省、市、区、部队各级各类医疗卫生机构261间，其中三甲医院10间，社区卫生服务中心18间（政府办14间、社会力量办4间），社区卫生服务站22间（政府办12间、社会力量办10间），区卫生监督所、区疾病预防控制中心、区妇幼保健院、区中医医院、区口腔医院、区社区卫生发展指导中心（区医管中心）各1间。

海珠区现有综合医院12个，中医医院3个，中西医结合医院1个，专科医院7个，社区卫生服务中心（站）43个，妇幼保健院2个，疾病预防控制中心2个，卫生监督所2个，疗养院1个。现状医疗设施有床位数10282张，位于广州第3位，其中综合医院7994张，中医医院345张，中西医结合医院646张，专科医院528张，社区卫生服务中心（站）468张，妇幼保健院100张，专科疾病防治院106张。海珠区现状医院的数量、床位数、千人常住人口床位数均位于全市中上游水平，整体服务能力较好。综合医院较多，其中三级医院占比为55%；中医医院（中西医结合医院）共有4个，其中三级医院占比50%。